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亚博体彩app -基因测序“摩尔定律”初现:三代测序要革“二代”的命?
时间:2021-01-22 来源:亚博体彩app 浏览量 99039 次

近日,邢正医药卫生发布了一份关于第三代基因测序行业的解释报告。动脉网指出,这份报告有助于医疗从业者对第三代测序技术和市场前景有一个全面的了解,所以才发表并整理出来。而第二代测序(NGS)还没有进入投资热潮,技术上取得巨大成就的第三代测序(3GS)已经转移到投资者的视野。1986年,第一代商用基因测序设备频繁出现,第二代测序设备频繁出现,间隔19年。

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第二代设备和第三代设备的出现,意味着五年后,基因测序设备的升级速度大大放缓。这只是2G手机跳过3G,需要跨越4G时代。报告从四个方面分析了第三代基因检测技术:1 .第三代基因检测技术的发展现状。

经过多年的发展,以Helicos公司的Heliscope单分子测序仪、PacificBiosciences公司的SMRT技术和OxfordNanoporeTechnologies公司的纳米孔单分子技术为代表的第三代测序技术逐渐成熟。虽然该技术仍存在成本高、错误率高、生物信息学分析软件丰富等问题,但在阅读宽度和测序速度方面具有明显优势。第三代测序设备已经稳定和小型化。

随着准确性、平行测序能力和酶活性的提高,第三代测序技术将成为未来最重要的技术趋势,大规模商业化建设将是大势所趋。2.指出Helicos公司的第三代基因测序法Helicos单分子测序仪、PacificBiosciences公司的SMRT技术和OxfordNanoporeTechnologies公司的纳米孔单分子技术是第三代测序技术的原理。与前两代技术相比,它们的第二个唯一特征是单分子测序,其中螺旋镜技术和SMRT技术利用荧光信号开始测序,而纳米孔单分子测序技术利用不同碱基产生的电信号开始测序。将PacBioSMRT技术应用到边制备边测序的思路中,以SMRT芯片作为测序载体,上面有很多小孔,每个孔都有DNA聚合酶。

测序的基本原理是:DNA聚合酶与模板融合,4种碱基(即dNTP)标记4种颜色的荧光。碱基配对阶段,重新加入不同的碱基,不会收到不同的光。根据光的波长和峰值,可以区分转移的碱基类型。

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DNA聚合酶是构建超长阅读长度的关键之一,主要与酶活性的维持有关,不受激光造成的损伤影响。此外,一些碱基标记条件可以通过检测两个相邻碱基之间的测序时间来检测。如果碱基没有标记,通过聚合酶的速度不会变慢,相邻两个峰之间的距离会减小,因此可以在相邻两个峰之间检测到甲基化等信息。

SMRT技术的测序速度很快,每秒大约有几个脱氧核糖核酸序列。但同时其测序错误率相对较低(这是目前单分子测序技术的通病),超过15%。但幸运的是,它的误差是随机的,而且和第二代测序技术一样,没有测序误差的偏差,所以可以通过多次测序来传播有效的数据流(成本是重复测序,也就是成本不会降低)。

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